MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ammonifex degensii KC4 chromosome

Total Repeats: 6074

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013385	TAC	2	6	1614469	1614474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_013385	GAAAAA	2	12	1614548	1614559	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_013385	CCCT	2	8	1616480	1616487	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5004	NC_013385	AG	3	6	1616541	1616546	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_013385	TCC	2	6	1620059	1620064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_013385	GCC	2	6	1620102	1620107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_013385	ACT	2	6	1621686	1621691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_013385	AAT	2	6	1621694	1621699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_013385	AC	3	6	1621704	1621709	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5010	NC_013385	GAAA	2	8	1621767	1621774	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013385	CT	3	6	1622017	1622022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5012	NC_013385	CTT	2	6	1622029	1622034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_013385	CCT	2	6	1622672	1622677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5014	NC_013385	CCTC	2	8	1624860	1624867	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5015	NC_013385	AGC	2	6	1624924	1624929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_013385	TTC	3	9	1624946	1624954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_013385	AC	3	6	1625013	1625018	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_013385	T	6	6	1625057	1625062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_013385	T	6	6	1625115	1625120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_013385	GCT	2	6	1625137	1625142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_013385	ACC	2	6	1625212	1625217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5022	NC_013385	CCG	2	6	1625237	1625242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5023	NC_013385	GCC	2	6	1625258	1625263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5024	NC_013385	T	6	6	1625448	1625453	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_013385	TTACCC	2	12	1625475	1625486	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5026	NC_013385	GAG	2	6	1625508	1625513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_013385	CCT	2	6	1625544	1625549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5028	NC_013385	TGA	2	6	1625555	1625560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_013385	GCA	2	6	1625564	1625569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_013385	CAC	2	6	1625587	1625592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5031	NC_013385	AGCGT	2	10	1625669	1625678	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5032	NC_013385	AAG	2	6	1625724	1625729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_013385	CCA	2	6	1625805	1625810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5034	NC_013385	AGGGCA	2	12	1625909	1625920	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5035	NC_013385	CTT	2	6	1625937	1625942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5036	NC_013385	GTC	2	6	1625948	1625953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_013385	TCC	2	6	1626205	1626210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_013385	C	6	6	1627105	1627110	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5039	NC_013385	CTC	2	6	1629469	1629474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5040	NC_013385	C	8	8	1629474	1629481	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5041	NC_013385	TAAT	2	8	1629491	1629498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_013385	AGT	2	6	1629505	1629510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_013385	ACCCC	2	10	1629546	1629555	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5044	NC_013385	TCC	2	6	1636092	1636097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_013385	T	8	8	1636130	1636137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_013385	CTCTC	2	10	1638129	1638138	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5047	NC_013385	CTG	2	6	1639247	1639252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_013385	CCT	2	6	1639283	1639288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5049	NC_013385	GCT	2	6	1639322	1639327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_013385	GCCCC	2	10	1639354	1639363	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5051	NC_013385	AAG	2	6	1639368	1639373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_013385	G	6	6	1639981	1639986	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013385	AG	3	6	1639989	1639994	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_013385	CCT	2	6	1641715	1641720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_013385	TCGA	2	8	1641733	1641740	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5056	NC_013385	CAC	2	6	1645504	1645509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_013385	A	6	6	1645540	1645545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_013385	ACCTCC	2	12	1645840	1645851	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_013385	GCC	2	6	1645862	1645867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_013385	CTG	2	6	1646916	1646921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_013385	C	6	6	1649209	1649214	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5062	NC_013385	CCAG	2	8	1653989	1653996	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_013385	GCT	2	6	1654002	1654007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_013385	GGCAA	2	10	1654042	1654051	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5065	NC_013385	CCT	2	6	1654398	1654403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5066	NC_013385	CTT	2	6	1655277	1655282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_013385	AGT	2	6	1655318	1655323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_013385	C	6	6	1655336	1655341	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5069	NC_013385	CCCT	2	8	1657274	1657281	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5070	NC_013385	CGG	2	6	1657373	1657378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_013385	C	6	6	1660714	1660719	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5072	NC_013385	CCG	2	6	1660728	1660733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5073	NC_013385	A	6	6	1660763	1660768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5074	NC_013385	AT	3	6	1660782	1660787	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5075	NC_013385	T	6	6	1665242	1665247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5076	NC_013385	CTC	2	6	1665248	1665253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5077	NC_013385	TA	3	6	1665285	1665290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5078	NC_013385	CCT	2	6	1665305	1665310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5079	NC_013385	GACC	2	8	1665324	1665331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5080	NC_013385	CTT	2	6	1665420	1665425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_013385	GT	4	8	1665460	1665467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_013385	GAA	2	6	1665508	1665513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_013385	G	6	6	1665520	1665525	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_013385	CTC	2	6	1668256	1668261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_013385	CCT	2	6	1668264	1668269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5086	NC_013385	TCC	2	6	1668271	1668276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_013385	A	6	6	1668290	1668295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013385	GCC	2	6	1668330	1668335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_013385	CCCCT	2	10	1670021	1670030	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
5090	NC_013385	CAC	2	6	1671584	1671589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_013385	CCT	2	6	1671800	1671805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_013385	TCCC	2	8	1673300	1673307	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5093	NC_013385	TTA	2	6	1673318	1673323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_013385	GGGA	2	8	1673325	1673332	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_013385	TAT	2	6	1673726	1673731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_013385	GCC	2	6	1673762	1673767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_013385	GGC	2	6	1673801	1673806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5098	NC_013385	GAG	2	6	1675530	1675535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5099	NC_013385	C	6	6	1676621	1676626	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5100	NC_013385	CCT	2	6	1677160	1677165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5101	NC_013385	AGC	2	6	1677230	1677235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5102	NC_013385	CCG	2	6	1677343	1677348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5103	NC_013385	CGC	2	6	1677416	1677421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_013385	GGAG	2	8	1677445	1677452	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_013385	AGCT	2	8	1677474	1677481	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5106	NC_013385	GAG	2	6	1677506	1677511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_013385	GAG	2	6	1677516	1677521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_013385	ACC	2	6	1677523	1677528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5109	NC_013385	CCG	2	6	1677554	1677559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5110	NC_013385	AGGT	2	8	1677787	1677794	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_013385	CTT	3	9	1677860	1677868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_013385	GGC	2	6	1677925	1677930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5113	NC_013385	CAG	2	6	1677989	1677994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_013385	CGT	2	6	1677998	1678003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_013385	TGC	2	6	1678019	1678024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_013385	CTG	2	6	1678126	1678131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5117	NC_013385	CGG	2	6	1678181	1678186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_013385	GCC	2	6	1678187	1678192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_013385	GAT	2	6	1678669	1678674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013385	CA	3	6	1678703	1678708	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_013385	GCC	2	6	1678719	1678724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_013385	GGGGC	2	10	1678743	1678752	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5123	NC_013385	T	8	8	1678765	1678772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_013385	TCA	2	6	1678784	1678789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_013385	ATG	2	6	1678798	1678803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_013385	A	6	6	1678868	1678873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_013385	T	7	7	1678902	1678908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_013385	ACC	2	6	1678945	1678950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_013385	GT	3	6	1679098	1679103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5130	NC_013385	ACC	2	6	1679117	1679122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5131	NC_013385	TCC	2	6	1679135	1679140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_013385	GGGC	2	8	1679309	1679316	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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5259	NC_013385	A	6	6	1730124	1730129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5260	NC_013385	AGG	2	6	1730163	1730168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5263	NC_013385	AGGA	2	8	1730330	1730337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5265	NC_013385	C	6	6	1730382	1730387	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5282	NC_013385	CCGA	2	8	1731622	1731629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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5398	NC_013385	GGGT	2	8	1794716	1794723	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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